Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm17190V9GX38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17190V9GX38 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms