Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac6Q9Z2V5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac6Q9Z2V5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac6Q9Z2V5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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