Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mbd3Q9Z2D8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms