Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mbd4Q9Z2D7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd4Q9Z2D7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms