Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccne2Q9Z238 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccne2Q9Z238 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms