Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trip6Q9Z1Y4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip6Q9Z1Y4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms