Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ap3b1Q9Z1T1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms