Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VarsQ9Z1Q9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VarsQ9Z1Q9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms