Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nek4Q9Z1J2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms