Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf1Q9Z1B8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Phf1Q9Z1B8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms