Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema4fQ9Z123 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sema4fQ9Z123 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms