Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmg20bQ9Z104 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmg20bQ9Z104 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms