Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slfn1Q9Z0I7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slfn1Q9Z0I7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slfn1Q9Z0I7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slfn1Q9Z0I7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms