Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn3Q9Z0G9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn3Q9Z0G9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms