Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pmfbp1Q9WVQ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms