Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PapolbQ9WVP6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PapolbQ9WVP6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms