Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnip1Q9WUU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnip1Q9WUU8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms