Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lhx9Q9WUH2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lhx9Q9WUH2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Lhx9Q9WUH2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms