Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pus1Q9WU56 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pus1Q9WU56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms