Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Scnn1bQ9WU38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Scnn1bQ9WU38 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms