Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MthfrQ9WU20 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MthfrQ9WU20 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MthfrQ9WU20 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MthfrQ9WU20 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MthfrQ9WU20 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms