Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PplQ9R269 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PplQ9R269 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms