Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lhx6Q9R1R0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lhx6Q9R1R0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms