Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NrkQ9R0G8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NrkQ9R0G8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms