Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zeb2Q9R0G7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zeb2Q9R0G7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms