Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Plod1Q9R0E2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod1Q9R0E2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms