Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Wdr54Q9R0D8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Wdr54Q9R0D8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms