Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Lamc3Q9R0B6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Lamc3Q9R0B6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lamc3Q9R0B6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms