Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AmfrQ9R049 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AmfrQ9R049 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms