Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtsjQ9R014 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsjQ9R014 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms