Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d3cQ9QZS8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms