Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Col4a3Q9QZS0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Col4a3Q9QZS0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms