Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp21Q9QZL6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp21Q9QZL6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp21Q9QZL6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms