Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nr4a3Q9QZB6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nr4a3Q9QZB6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms