Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

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Length 761 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Phtf1Q9QZ09 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Phtf1Q9QZ09 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Phtf1Q9QZ09 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phtf1Q9QZ09 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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