Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trim44Q9QXA7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trim44Q9QXA7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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