Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG3

Tmub1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub1Q9JMG3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmub1Q9JMG3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmub1Q9JMG3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms