Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrfQ9JM73 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SrfQ9JM73 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SrfQ9JM73 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms