Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Higd1aQ9JLR9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Higd1aQ9JLR9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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