Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM4

Zmym3, Zinc finger MYM-type protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmym3Q9JLM4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zmym3Q9JLM4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Zmym3Q9JLM4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zmym3Q9JLM4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms