Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG8

Capn15, Calpain-15, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn15Q9JLG8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn15Q9JLG8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Capn15Q9JLG8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms