Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tgm1Q9JLF6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tgm1Q9JLF6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tgm1Q9JLF6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Tgm1Q9JLF6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Tgm1Q9JLF6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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Tgm1Q9JLF6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tgm1Q9JLF6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms