Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TefQ9JLC6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TefQ9JLC6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms