Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gde1Q9JL56 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gde1Q9JL56 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms