Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace2Q9JL18 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace2Q9JL18 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace2Q9JL18 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace2Q9JL18 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace2Q9JL18 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace2Q9JL18 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace2Q9JL18 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bace2Q9JL18 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace2Q9JL18 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace2Q9JL18 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bace2Q9JL18 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms