Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Isg20Q9JL16 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Isg20Q9JL16 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms