Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trem1Q9JKE2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trem1Q9JKE2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms