Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alyref2Q9JJW6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms