Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR9

Nrip3, Nuclear receptor-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip3Q9JJR9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrip3Q9JJR9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrip3Q9JJR9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms