Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ascl3Q9JJR7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ascl3Q9JJR7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms